穆棱河在穆棱市境内大小支流和沟叉有条，流域面积超过30平方公里的39条，河流长度超过10公里51条，其中流长在50公里以上的有荒草沟河、大石头河、雷峰岐河和亮子河。穆棱河两岸山多林密，自然资源丰富，土地肥沃，灌溉便利，为农林牧副渔业和多种经营的综合发展提供极为有利的自然条件。
但穆棱河属山间性河流，在本县开发初期，三岔以下河流两岸多为森林所覆盖，河窄水深，崖陡流急，30年代林木砍伐殆尽，尚有柳毛通分布，50年代以后河两岸尽辟农田，柳毛灌丛已绝迹，河床展宽泛区加多，水浅流缓。每年春，秋汛期河水易涨，7、8月份在降水过多的年份，经常引起山洪暴发和泥石流发生，危及两岸农田和人民生命财产，因此穆棱河又称牤牛河，形容洪水汹猛，如无羁牤牛狂奔。
穆棱河在密山县境内，年平均流量为77.01立方米/秒，年平均径流深为毫米，年径流量为22.08亿立方米。年径流大部分集中7、8、9三个月，春季5、6月的径流量一般占全年的20%，冬季12、1、2、3月的径流量一般不到全年的5%。
穆棱河在鸡西市境内河段，据记载，年，水深3米多，浅处1.5米，可通航民用载重船，盛产近40种鱼类。50年代，水深2—2.5米，两岸有20—30米宽柳树林带，水清见底，鱼类甚多。60年代以来，沿岸柳树被砍光，荒地被开垦，河岸塌陷后退，造成水土流失。据测量，—年的5年间，河水平均含沙量32公斤/立方米，—年增加到46.7公斤/立方米，增长45.9%。年测量，河床比年显著提高，抬高量八面通一带为0.8—1米，梨树镇至鸡西市区段1.2—1.5米。现河深仅2米左右，河宽由50年代的30—40米增加到现在的60—80米，早已不能通航，水中鱼类极少。封河期11月上旬，开河期4月上旬。
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